Директор музея «Пермь‑36» Наталия Семакаева заявила, что в список «террористов и экстремистов» попала не юридическая организация нынешнего музея, а другая некоммерческая организация, ранее с ним связанная.
По её словам, внесённая в реестр НКО существовала около десяти лет и была ликвидирована примерно в 2015–2016 годах. Современное музейное учреждение напрямую с этой организацией не связано.
Официальное юридическое название музея — Государственное бюджетное учреждение культуры Пермского края «Мемориальный музей‑заповедник истории политических репрессий «Пермь‑36». В реестр же попала Автономная некоммерческая организация «Мемориальный центр истории политических репрессий «Пермь‑36».
Некоммерческая организация была основана в 2001 году, создала музей и управляла им до середины 2010‑х. Затем управление комплексом перешло к местным властям: создали государственную организацию, которой передали имущество лагеря, архивы, библиотеку и экспозиции. В число консультантов нового госучреждения вошли бывшие сотрудники и охранники ФСИН.
НКО была признана «иностранным агентом» в 2015 году, а затем ликвидирована. В 2023 году появилась виртуальная версия музея, созданная в Казахстане; руководителем проекта стала Юлия Балабанова. Проект просуществовал около года, сейчас его страницы в соцсетях и сайт неактивны. В 2025 году скончался один из участников команды виртуального проекта, Виктор Шмыров.
